Ved at leve efter den autoimmune palæokost fjerner du automatisk de fødevarer, der indeholder stoffer, som er problematiske for tarmen. Her fjerner du kornprodukter (som bl.a. indeholder gluten), bælgfrugter, tilsat sukker, æg, mælkeprodukter, nødder, kerner, frø og natskyggefamilien (kartofler, auberginer, peberfrugter osv.)